Databáze | Webová stránka | Zaměření |
NCBI (National Center for Biotechnology Information) | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ | Nabízí několik biotechnologických a biomedicínských databází a nástrojů. |
PubMed (součástí NCBI) | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ | Biomedicínská bibliografická databáze |
Epigenomic Database (součástí NCBI) | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/epigenomics | Databáze epigenetických modifikacíArabidopsis thalianaCaenorhabditis elegansDrosophila melanogasterHomo sapiensMus musculus |
Web of Science | http://thomsonreuters.com/thomson-reuters-web-of-science/ | bibliografická a citační databáze |
Databáze nukleotidových sekvencí | ||
GenBank (National Center for Biotechnology Information) Součástí NCBI | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide | Databáze nukleotidových sekvencí s doprovodnými bibliografickými a biologickými informacemi |
DDBJ (DNA Data Bank of Japan) | http://www.ddbj.nig.ac.jp/ | Je součástí INSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration), poskytuje informace o nukleotidových sekvencích |
EBI (The European Bioinformatics Institute) | http://www.ebi.ac.uk/ | Databáze bioinformatických informací |
Genomové databáze | ||
Ant genomics database – Fourmidable | http://www.antgenomes.org/
|
mravenci |
Banana Genome Hub | http://banana-genome.cirad.fr/ | Musa acuminata |
EcoCyc | http://ecocyc.org/ |
|
Ensembl | http://www.ensembl.org/index.html | člověk, myš, další obratlovci a jiné eukaryotní genomy |
PATRIC ( the PathoSystems Resource Integration Center) | http://patricbrc.vbi.vt.edu/portal/portal/patric/Home | patogenní baktérie |
FlyBase | http://flybase.org/ | Drozofila |
MaizeGDB | http://www.maizegdb.org/ | Kukuřice |
MGI (Mouse Genome Informatics) | http://www.informatics.jax.org/ | myš |
http://www.hgmd.org/ | člověk | |
JGI: | http://genome.jgi.doe.gov/ | různé genomy |
National Microbial Pathogen Data Resource NMPDR NMPDR | http://www.nmpdr.org/FIG/wiki/view.cgi | Campylobacter, Listeria, Staphylococcus, Streptococcus, Vibrio; Chlamydiaceae, Haemophilus, Mycoplasma, Neisseria, Treponema, Ureaplasma. |
Regulon | http://regulondb.ccg.unam.mx/ | he primary database on transcriptional regulation in Escherichia coli K-12 |
SGD (Saccharomyces genome database) | http://www.yeastgenome.org/ | Saccharomyces cerevisiae |
Sol Genomics | http://solgenomics.net/ | Solanum, Nicotiana, Capsicum, Petunia |
TAIR (Arabidopsis Biological Resource Center) | http://www.arabidopsis.org/ | Arabidopsis |
Xenbase | http://www.xenbase.org/entry/ | Xenopus tropicalis, Xenopus laevis |
Wormbase | http://www.wormbase.org/#01-23-6 | Coenorhabditis elegans a další nematoda |
UCSC Genome Bioinformatics | https://genome.ucsc.edu/ | Různé genomy |
RGD (Rat genome database) | http://rgd.mcw.edu/ | Rattus norvegicus |
VectorBase | https://www.vectorbase.org/ | Aedes aegypti, Anopheles gambiae,Culex quinquefasciatus, Ixodes scapularis, Pediculus humanus, Rhodnius prolixus |
ZFIN (The Zebrafish Model Organism Database) | http://zfin.org/ | Danio rerio |